1、阴凉通风处保存。新鲜的莲子在常温下保存的时间是比较短的，可以将新鲜的莲子直接放到阴凉通风的环境中进行保存，但是要注意，要确保莲子在莲蓬中不要取出来，这种保存的方法一般保存5-7天是不会出现变化的。
2、冰箱冷藏保存。将莲子放到冰箱中冷藏保存，首先要将新鲜的莲子外皮去除，然后再把它放到保鲜盒中，将保鲜盒的盖子盖紧，最后将它直接放到冰箱的冷藏室里面进行冷藏即可。用冷藏的方式通常保存10天，是不会出现变质的。
3、冷冻保存。如果想把莲子保存的时间更长的话，那么可以选择冷冻的方式来保存莲子，这种方法保存的时间是比较长的，首先将新鲜的莲子处理干净，然后用保鲜膜将其包裹起来或者直接放到密封的保鲜袋中，然后再把它放到冰箱的冷冻室里面冷冻起来，冷冻起来保存最长可以达到一年左右都不会出现变质，但是口感会差一些。